###从NCBI下载基因组(DNA)/转录组(RNA)测序数据到获得预测基因的处理步骤（以Nyctotherus_ovalis物种为例，见/home/Data_01/yizhenzhen06/public_share/Saccharomyces_cerevisiae_DNA。如果没有注明仅基因组数据要做，其他步骤基因组和转录组步骤一样。直接写在本文件里的美丽表示可以直接终端运行指令，其他指令要提交pbs任务运行。

Trinity --seqType fq --max_memory 50G --no_version_check \
--left species_name_1_p.fastq \
--right species_name_2_p.fastq \
--CPU XX 
#RNA数据用Trinity组装，--CPU调整调用cpu核心数，其它参数需根据具体数据情况进行调整，提交脚本运行。

spades.py --sc -t XX -m 230 \
-1 species_name_1_p.fastq \
-2 species_name_2_p.fastq \
-o spades_species_name
#DNA数据用spades组装，-t调整调用cpu核心数，其它参数需根据具体数据情况进行调整，提交脚本运行。

busco -i spades/scaffolds.fasta -m XXX \
-l /home/Data_01/share_databases/busco/alveolata_odb10/alveolata_odb10 \
-o busco_out_alve --offline -f 
#BUSCO 检测完整度，-m调整评估模式(trans转录组 geno基因组)